Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttf2Q5NC05 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ttf2Q5NC05 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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