Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp19Q3UJD6 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp19Q3UJD6 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp19Q3UJD6 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp19Q3UJD6 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp19Q3UJD6 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp19Q3UJD6 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp19Q3UJD6 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp19Q3UJD6 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp19Q3UJD6 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp19Q3UJD6 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp19Q3UJD6 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp19Q3UJD6 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp19Q3UJD6 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp19Q3UJD6 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp19Q3UJD6 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms