Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Q3U6N9 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Q3U6N9 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Q3U6N9 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Q3U6N9 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Q3U6N9 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Q3U6N9 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Q3U6N9 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Q3U6N9 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Q3U6N9 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Q3U6N9 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Q3U6N9 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Q3U6N9 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Q3U6N9 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Q3U6N9 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Q3U6N9 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Q3U6N9 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Q3U6N9 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Q3U6N9 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Q3U6N9 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Q3U6N9 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Q3U6N9 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Q3U6N9 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Q3U6N9 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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