Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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