Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ttc39dQ0VF76 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms