Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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Hoxd1Q01822 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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Hoxd1Q01822 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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Hoxd1Q01822 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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Hoxd1Q01822 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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