Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PtprmP28828 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PtprmP28828 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PtprmP28828 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PtprmP28828 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PtprmP28828 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PtprmP28828 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PtprmP28828 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PtprmP28828 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PtprmP28828 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PtprmP28828 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PtprmP28828 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm22489-201ENSMUST00000116813 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
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