Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RxraP28700 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RxraP28700 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RxraP28700 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RxraP28700 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RxraP28700 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RxraP28700 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RxraP28700 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RxraP28700 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RxraP28700 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RxraP28700 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RxraP28700 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RxraP28700 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RxraP28700 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RxraP28700 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RxraP28700 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RxraP28700 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RxraP28700 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RxraP28700 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RxraP28700 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RxraP28700 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.54□□□□□ -2
RxraP28700 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RxraP28700 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RxraP28700 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RxraP28700 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RxraP28700 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RxraP28700 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RxraP28700 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RxraP28700 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RxraP28700 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RxraP28700 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RxraP28700 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RxraP28700 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RxraP28700 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RxraP28700 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RxraP28700 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RxraP28700 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RxraP28700 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RxraP28700 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RxraP28700 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RxraP28700 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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