Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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PdgfraP26618 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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PdgfraP26618 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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PdgfraP26618 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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PdgfraP26618 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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PdgfraP26618 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PdgfraP26618 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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