| Hoxd12 | P23812 | Gm26400-201 | ENSMUST00000175012 | 85 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm24618-201 | ENSMUST00000177718 | 94 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm23953-201 | ENSMUST00000178214 | 94 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm26332-201 | ENSMUST00000179813 | 94 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm22263-201 | ENSMUST00000180060 | 104 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm22863-201 | ENSMUST00000180265 | 94 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | 1700015G11Rik-203 | ENSMUST00000185841 | 305 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm18453-201 | ENSMUST00000208000 | 626 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
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| Hoxd12 | P23812 | Gm15098-201 | ENSMUST00000119036 | 1508 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
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| Hoxd12 | P23812 | Gm35077-201 | ENSMUST00000204999 | 275 nt | TSL 3 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
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| Hoxd12 | P23812 | CT030166.2-201 | ENSMUST00000222021 | 368 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
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| Hoxd12 | P23812 | mt-Nd5-201 | ENSMUST00000082418 | 1824 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Mir29b-2-201 | ENSMUST00000083478 | 81 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm24522-201 | ENSMUST00000083964 | 108 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Scgb1b24-201 | ENSMUST00000108087 | 279 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Rpl31-ps6-201 | ENSMUST00000119959 | 378 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm23120-201 | ENSMUST00000157654 | 287 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm22951-201 | ENSMUST00000179471 | 107 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm28257-201 | ENSMUST00000185244 | 463 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm38361-201 | ENSMUST00000193419 | 458 nt | TSL 5 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm45522-201 | ENSMUST00000210784 | 166 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Sprr4-201 | ENSMUST00000062129 | 231 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | n-R5s197-201 | ENSMUST00000083302 | 119 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm42755-201 | ENSMUST00000198533 | 1493 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Vmn2r72-201 | ENSMUST00000063425 | 2571 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Trdj2-201 | ENSMUST00000103683 | 59 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
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| Hoxd12 | P23812 | Gm13457-201 | ENSMUST00000117885 | 267 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm13862-201 | ENSMUST00000121220 | 197 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
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| Hoxd12 | P23812 | Gm23557-201 | ENSMUST00000157820 | 138 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm22517-201 | ENSMUST00000158265 | 136 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
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| Hoxd12 | P23812 | Gm23005-201 | ENSMUST00000158950 | 136 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm24085-201 | ENSMUST00000175172 | 116 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm9830-201 | ENSMUST00000178509 | 357 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm22448-201 | ENSMUST00000179254 | 107 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm26979-201 | ENSMUST00000182971 | 217 nt | TSL 3 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm20257-202 | ENSMUST00000188643 | 130 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm45678-201 | ENSMUST00000210509 | 295 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | AC130821.1-201 | ENSMUST00000221997 | 293 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm26265-201 | ENSMUST00000083277 | 135 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Tlr7-202 | ENSMUST00000112161 | 3897 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Vmn1r185-204 | ENSMUST00000227411 | 4928 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm23941-201 | ENSMUST00000101953 | 107 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Cypt15-201 | ENSMUST00000115114 | 519 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Gm12304-201 | ENSMUST00000120312 | 385 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| Hoxd12 | P23812 | Mir6376-201 | ENSMUST00000185149 | 131 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |