Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms