Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23735-201ENSMUST00000082551 134 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms