Protein–RNA interactions for Protein: D3YXG0

Hmcn1, Hemicentin-1, mousemouse

Predictions only

Length 5,634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn1D3YXG0 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm25023-201ENSMUST00000082977 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm28057-201ENSMUST00000186603 615 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 9230110F11Rik-202ENSMUST00000212907 191 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Vmn1r81-203ENSMUST00000227973 14002 ntAPPRIS P2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
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Hmcn1D3YXG0 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
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Hmcn1D3YXG0 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.24
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Hmcn1D3YXG0 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 CT030166.3-201ENSMUST00000223203 193 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm26491-201ENSMUST00000179268 121 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Hmcn1D3YXG0 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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