Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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