Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm23671-201ENSMUST00000157472 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
H2-M5A7VMS3 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
H2-M5A7VMS3 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.4 ms