Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cldn8Q9Z260 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cldn8Q9Z260 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cldn8Q9Z260 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cldn8Q9Z260 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Cldn8Q9Z260 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cldn8Q9Z260 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Cldn8Q9Z260 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cldn8Q9Z260 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cldn8Q9Z260 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Cldn8Q9Z260 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cldn8Q9Z260 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cldn8Q9Z260 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Cldn8Q9Z260 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
Cldn8Q9Z260 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms