Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm37777-201ENSMUST00000195546 3366 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm25765-201ENSMUST00000104100 132 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm27392-201ENSMUST00000185041 101 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm22890-201ENSMUST00000158642 144 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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