Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
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AtrQ9JKK8 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
AtrQ9JKK8 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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AtrQ9JKK8 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Gm25388-201ENSMUST00000157339 151 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Gm22429-201ENSMUST00000158553 130 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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AtrQ9JKK8 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
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AtrQ9JKK8 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
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AtrQ9JKK8 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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AtrQ9JKK8 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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AtrQ9JKK8 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
AtrQ9JKK8 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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