Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms