Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp29Q9ES63 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms