Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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Ccdc39Q9D5Y1 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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Ccdc39Q9D5Y1 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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Ccdc39Q9D5Y1 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm22418-201ENSMUST00000180326 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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