Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm25064-201ENSMUST00000179535 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm26295-201ENSMUST00000179690 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22823-201ENSMUST00000179754 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22360-201ENSMUST00000179775 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24978-201ENSMUST00000179782 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24967-201ENSMUST00000179791 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22288-201ENSMUST00000179904 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm23512-201ENSMUST00000180237 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm25327-201ENSMUST00000180263 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm26058-201ENSMUST00000180294 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22418-201ENSMUST00000180326 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm23629-201ENSMUST00000082465 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm23924-201ENSMUST00000082474 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22246-201ENSMUST00000082478 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22749-201ENSMUST00000082490 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22747-201ENSMUST00000082495 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22063-201ENSMUST00000082560 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm23057-201ENSMUST00000082801 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm26331-201ENSMUST00000082824 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24205-201ENSMUST00000082953 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm25405-201ENSMUST00000082973 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22628-201ENSMUST00000082988 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm26324-201ENSMUST00000083073 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24535-201ENSMUST00000083140 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm26496-201ENSMUST00000083150 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm26127-201ENSMUST00000083193 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24456-201ENSMUST00000083198 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24458-201ENSMUST00000083204 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24018-201ENSMUST00000083232 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm25790-201ENSMUST00000083293 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22295-201ENSMUST00000083311 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm25127-201ENSMUST00000083336 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm25583-201ENSMUST00000083413 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm25577-201ENSMUST00000083414 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24414-201ENSMUST00000083434 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24861-201ENSMUST00000083459 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24803-201ENSMUST00000083693 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm23103-201ENSMUST00000083725 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22580-201ENSMUST00000083727 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24260-201ENSMUST00000083741 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm23732-201ENSMUST00000083751 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22682-201ENSMUST00000083854 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm25869-201ENSMUST00000083855 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24693-201ENSMUST00000083885 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm26317-201ENSMUST00000083894 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22798-201ENSMUST00000083992 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm26427-201ENSMUST00000093648 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22170-201ENSMUST00000097247 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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