Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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Sgo1Q9CXH7 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
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Sgo1Q9CXH7 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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Sgo1Q9CXH7 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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Sgo1Q9CXH7 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
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Sgo1Q9CXH7 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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