Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Hdac9Q99N13 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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Hdac9Q99N13 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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Hdac9Q99N13 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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Hdac9Q99N13 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Hdac9Q99N13 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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Hdac9Q99N13 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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