Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Clstn3Q99JH7 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Clstn3Q99JH7 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Clstn3Q99JH7 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Clstn3Q99JH7 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Clstn3Q99JH7 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Clstn3Q99JH7 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Clstn3Q99JH7 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Clstn3Q99JH7 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Clstn3Q99JH7 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Clstn3Q99JH7 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Clstn3Q99JH7 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Clstn3Q99JH7 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Clstn3Q99JH7 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Clstn3Q99JH7 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Clstn3Q99JH7 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Clstn3Q99JH7 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Clstn3Q99JH7 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Clstn3Q99JH7 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms