Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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Usp38Q8BW70 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp38Q8BW70 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp38Q8BW70 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp38Q8BW70 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp38Q8BW70 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp38Q8BW70 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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