Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.9 ms