Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm24018-201ENSMUST00000083232 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NischQ80TM9 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.53□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.53□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm25248-201ENSMUST00000175473 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.7 ms