Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Mir142b-201ENSMUST00000083486 115 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm23918-201ENSMUST00000175253 106 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC-0.21□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
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