Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Q3U6N9 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Q3U6N9 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Q3U6N9 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Q3U6N9 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Q3U6N9 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Q3U6N9 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Q3U6N9 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Q3U6N9 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Q3U6N9 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Q3U6N9 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Q3U6N9 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Q3U6N9 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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