Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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