Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 1700027F06Rik-201ENSMUST00000203901 243 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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ptchd1Q14B62 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Olfr986-203ENSMUST00000216720 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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ptchd1Q14B62 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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ptchd1Q14B62 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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ptchd1Q14B62 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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ptchd1Q14B62 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Tbx22-201ENSMUST00000068451 2947 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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