Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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Hoxd1Q01822 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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Hoxd1Q01822 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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