Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RxraP28700 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RxraP28700 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RxraP28700 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RxraP28700 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RxraP28700 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RxraP28700 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RxraP28700 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RxraP28700 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RxraP28700 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RxraP28700 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RxraP28700 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RxraP28700 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RxraP28700 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RxraP28700 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RxraP28700 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
RxraP28700 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
RxraP28700 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RxraP28700 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RxraP28700 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RxraP28700 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RxraP28700 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RxraP28700 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RxraP28700 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RxraP28700 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RxraP28700 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RxraP28700 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RxraP28700 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RxraP28700 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RxraP28700 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RxraP28700 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RxraP28700 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RxraP28700 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RxraP28700 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RxraP28700 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RxraP28700 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RxraP28700 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
RxraP28700 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RxraP28700 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms