Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 mt-Tl1-201ENSMUST00000082391 75 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm22757-201ENSMUST00000102279 96 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm25108-201ENSMUST00000122473 78 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC0.11□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm22942-201ENSMUST00000158563 124 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Polr1aO35134 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.5 ms