Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
Zfp558E9Q1J0 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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Zfp558E9Q1J0 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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Zfp558E9Q1J0 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Zfp558E9Q1J0 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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