Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms