Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Trabd2bB1ATG9 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.7 ms