Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Grik3B1AS29 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Grik3B1AS29 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Grik3B1AS29 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.53□□□□□ -2
Grik3B1AS29 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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