Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
H2-M5A7VMS3 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
H2-M5A7VMS3 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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