Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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