Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CtcflA2APF3 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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