Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pkp3Q9QY23 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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