Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm23152-201ENSMUST00000175322 116 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Olfr898-202ENSMUST00000216304 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm11982-201ENSMUST00000121480 314 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm25481-201ENSMUST00000083221 158 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm3646-201ENSMUST00000171319 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm5829-201ENSMUST00000191383 351 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rabgef1Q9JM13 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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