Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm23092-201ENSMUST00000178688 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm25709-201ENSMUST00000178844 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm25547-201ENSMUST00000178877 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm22618-201ENSMUST00000179376 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24182-201ENSMUST00000179419 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc47Q9D024 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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