Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Hdac9Q99N13 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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