Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp38Q8BW70 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms