Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg4cQ811C2 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Atg4cQ811C2 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 329.3 ms