Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Actn1Q7TPR4 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.5 ms