Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm27935-201ENSMUST00000183894 79 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm25149-201ENSMUST00000157119 82 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Mirlet7b-201ENSMUST00000083630 85 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm27944-201ENSMUST00000185155 103 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm45617-201ENSMUST00000211132 209 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC-0.14□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm22813-201ENSMUST00000199948 123 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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