Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Mir26a-1-201ENSMUST00000083579 90 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
Hoxa13Q62424 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
Hoxa13Q62424 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxa13Q62424 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxa13Q62424 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxa13Q62424 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxa13Q62424 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms